在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，朱耐根也被列入其中。苏少卿在《剧评》上赞扬了朱氏的声音和腔调：“如浮云遮月”，并认为他的声音媲美小余，更是技艺炉火纯青。

随着年岁的增长，朱耐根作为一名票友，在上海定居，他在当地被尊称为“耐二爷”，并被视为票界的宗师。他精通谭派唱腔，并曾经在扬州和常州传授自己的技艺。宝应的一些票友，如佑申和郭季良，与他结拜，一起切磋技艺，他们都受益匪浅。在宝应地区学习京剧的人数颇多，这也归功于朱氏对京剧艺术的推广。他的夫人魏雅兰也是一个资深的票友。

三张由高亭和百代公司灌制的唱片收录了朱耐根独特的声音，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是第一批记录下谭鑫培声学艺术的人物，因此它们成为了研究谭派声腔艺术珍贵资料（现存上海图书馆）。