在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在北京，他对皮黄腔的热爱让他得以学习谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了多次免费演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音：“如浮云遮月”，并称他的声音媲美小余，而且他的传音区别之处更是苍劲有力，让人感受到了炉火纯青的技艺。在中年之后，朱耐根选择以票友身份生活在上海，那时候，他被尊称为“耐二爷”，并被视为票界的一位宗师。他的唱腔专长于谭派，并曾在扬州和常州教授艺术。

宝应地区的票友们，如居佑申和郭季良，与朱氏结拜，他们经常切磋技艺，对于他们而言，得到朱氏教诲是一大幸事。此后，在宝应地区流行京剧的人数不少，这也归功于对话士们所接受的心灵洗礼。值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是一个资深的票友。

关于他的唱腔，有三张唱片由高亭公司和百代公司灌制，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是在谭鑫培之前录制出来，所以它们成为了研究谭派声乐艺术不可多得的资料。这三张唱片至今仍然保存在上海图书馆，为研究者提供了一种直接体验古代音乐家的艺术表现形式。