在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他。他得到了谭鑫培的真传，并将此技艺带入上海、杭州、汉口和常州等地，以票友的身份进行义务演出。与王君直齐名，他们共同被誉为“南朱北王”。著名京剧学者陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派的杰出人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿曾在《剧评》中赞扬朱耐根的声音，“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青。”后来，朱耐根以票友身份定居上海，在当地被尊称为“耐二爷”，并被视为票界中的宗师。他精通谭派唱腔，并且曾经在扬州和常州教授这一艺术形式。宝应票友中的佑申和郭季良都是他的结拜兄弟，与他切磋技艺，受益匪浅。在宝应研究京剧的人士众多，这也可以追溯到他们对朱氏技艺的影响。甚至于他的夫人魏雅兰也是一个票友。

朱耐根留给我们的唱腔录音，是高亭和百代两家公司灌制的一张三张唱片。这三张唱片包含了《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些录音是由谭鑫培本人未曾录制过的，因此对于理解谭派声腔艺术，它们具有不可替代的地位现在，这些珍贵的资料保存在上海图书馆里。