在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，作为一名票友，他在上海、杭州、汉口和常州等地进行了无偿表演。与另一位票友王君直齐名，他们共同被称为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音“如浮云遮月”，与小余相比，更是声色圆熟而技艺高超。

当朱耐根年事已高时，他以票友身份定居于上海，在那儿他被尊称为“耐二爷”并被视为票界的宗师。他精通谭派唱腔，并曾在扬州和常州教授艺术。此外，他与宝应的票友们——佑申和季良有着结拜之交，他们经常切磋技艺，从而受益匪浅。在宝应地区学习京剧的人颇多，这也归功于朱氏的影响力。而他的夫人魏雅兰也是一个资深的票友。

三张由高亭和百代公司发行的大碟收录了朱耐根独特的声音，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（合作演出）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于谭鑫培未曾录制这些作品，因此这三张大碟成为了研究谭派声乐艺术宝贵资料（目前存放于上海图书馆）。