在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，朱耐根就是其中之一。苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音“如浮云遮月”，并称其唱腔媲美小余，更是技艺炉火纯青。

当年轻时期过去之后，朱耐根以票友身份定居上海，那里的票界尊称他为“耐二爷”，并视他为票界的宗师。他精通谭派唱腔，并曾经在扬州和常州传授技艺。在宝应地区，有些票友，如佑申和季良，与朱氏结拜，他们经常切磋技艺，并从中学到了不少。后来，不仅宝应地区，还有很多人学习京剧，这也都是受益于朱氏。

值得一提的是，朱耐根的夫人魏雅兰也是一个知名的票友。她与丈夫一起合作，一起传承着京剧艺术。

至于他的唱腔，它被高亭和百代两家公司灌录成三张唱片。这包括《法场换子》、《梅龙镇》（这首歌曲是夫妻合演）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是在谭鑫培灌录之前制作的，所以它们成为研究谭派声腔艺术的一份珍贵资料（现在这些唱片已经存放在上海图书馆）。