在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他。他得到了谭鑫培的真传，并将此技艺带入上海、杭州、汉口和常州等地，以票友的身份进行义务演出。与王君直齐名，他被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提及的谭派巨匠之一，朱耐根就是其中一个。在苏少卿的《剧评》中，他对朱氏的声音赞誉有佳：“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青”。

随着年华的流逝，朱耐根以票友之姿定居于上海，在当地文化界被尊称为“耐二爷”，并且成为票界的一位宗师。他的唱腔专长于谭派，他曾经在扬州和常州教授这门艺术。宝应地区的一些票友，如佑申和郭季良，与他结拜，并多次切磋技艺，他们都受益于他的教导。后来，宝应地区对京剧学习者众多，这也正是因为受到朱耐根影响。

值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是一个票友。她与丈夫共同演绎了一段辉煌的人生。在音乐领域，她留下了不朽的遗产，即三张由高亭和百代两公司制作发行的唱片。这三张唱片收录了《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片中的声音保留了谭鑫培没有灌制过的声音，因此它们成为了研究谭派声乐艺术不可多得的珍贵资料（现存上海图书馆）。