在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音“如浮云遮月”，并称其媲美小余，其传唱技艺尤其精湛，更是炉火纯青。随着年岁的增长，朱耐根以票友身份定居于上海，在当地被尊称为“耐二爷”，并被视为票界中的宗师。在他的晚年，他精通谭派唱腔，并曾在扬州和常州传授自己的技艺。宝应地区的一些票友，如居佑申和郭季良，与他结拜，并且经常切磋技艺，他们深受他的教益，对宝应地区研究京剧的人有很大影响。

值得一提的是，朱耐根的夫人魏雅兰也是一个资深的票友。在艺术上，朱氏留下了一系列珍贵的声音资料，这些都是研究谭派声腔艺术不可多得的资源。他灌录过三张唱片，即《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）和《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些作品是在谭鑫培之后完成，因此成为了研究谭派声音艺术的一个重要参考（现在这几张唱片已经存放在上海图书馆）。