在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名京剧学者陈小田在其作品《京剧音韵概论》中提到谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音“如浮云遮月”，与小余相媲美，更是声色俱佳。在他的晚年，朱耐根以票友的身份生活在上海，那里的人们尊称他为“耐二爷”，并将他视作票界的宗师。作为谭派唱腔的大师，朱氏曾经在扬州和常州教授过艺术。而宝应地区的票友，如佑申和郭季良，与朱氏有着深厚的情谊，他们经常一起学习技艺，从而受益匪浅。甚至连宝应地区研究京剧的人士也多受到了他的影响。值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是一个资深的票友。

他的唱腔曾被高亭和百代两家公司录制成三张唱片，其中包含了《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作）。由于这些唱片是由谭鑫培本人未录制过的声音资料，所以对于研究谭派声腔艺术来说是一份极为珍贵且难得的地带（现存于上海图书馆）。