在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他，他甚至得到了谭鑫培的真传。后来，他以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行义务性的演出，与另一位票友王君齐名，被誉为“南朱北王”。著名的京剧音乐家陈小田，在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，朱耐根就是其中之一。苏少卿在他的文章《剧评》中，对朱耐根的声音技巧给予了高度评价：“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青”。

随着年龄的增长，朱耐根继续以票友身份生活在上海，那里的人们尊称他为“耐二爷”，并将他视为票界的一位宗师。他精通谭派唱腔，并且曾经在扬州和常州传授自己的技艺。在那里，他结拜了许多朋友，如宝应票友居佑申和郭季良，他们与他切磋技艺，并从中学到了很多。这也影响了宝应地区对京剧艺术的研究，因为他们受到了朱耐根的启发。

值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是一个票友。在她的丈夫活着的时候，他录制了一些唱片，其中包括《法场换子》，《梅龙镇》（这次合作是夫妻共演）以及《探母回令》（这是与陈小田合作的一个作品）。由于这些唱片是在谭鑫培之后录制出来的，因此它们成为了研究谭派声腔艺术极其珍贵的声音资料（现在，这些唱片保存在上海图书馆）。