在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他。他得到了谭鑫培的真传，并将此技艺带入上海、杭州、汉口和常州等地，以票友的身份进行义务演出。与王君直齐名，他们共同被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提及谭派的杰出人物，朱耐根就是其中之一。苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音，“如浮云遮月”，媲美小余，其传唱区区苍劲，更是炉火纯青。

随着年岁的增长，朱耐根以票友身份定居上海，在当地被尊称为“耐二爷”并视为票界中的宗师。他精通谭派唱腔，并曾在扬州和常州教授这门艺术。宝应地区的一些票友，如佑申和郭季良，与他结拜并经常切磋技艺，他们对他的教诲怀有深刻的敬意。在后来的宝应研究京剧的人们众多，这也可以归功于朱氏对他们影响力的传承。值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是位熟练的票友。

三张由高亭和百代公司发行的唱片，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）和《探母回令》（与陈小田合作），这些唱片不仅展示了谭鑫培未曾灌录过的声音，也成为了研究谭派声腔艺术不可多得的资料。这三张珍贵的地面资料目前存放在上海图书馆，是研究者难能可贵的一个发现。