在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住在京城，深爱皮黄班，他甚至得到了谭鑫培的真传。后来以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地，他曾有过义务性的表演。在那个时代，与另一位票友王君直齐名，他们共同被誉为“南朱北王”。著名的票友陈小田，在其所著的《京剧音韵概论》一书中提到过谭派中的杰出人物，朱耐根就赫然列入其中。苏少卿在他的文章《剧评》中，对朱氏的声音腔进行了赞赏，他认为那是一种如同浮云遮蔽月亮一样美妙的声音，而与小余相比，那更加具有苍劲和炉火纯青之处。

当朱耐根年纪渐长，他仍以票友的身份生活在上海。在那里，他被尊称为“耐二爷”，并且被视为票界中的宗师。他精通谭派唱腔，并曾经在扬州和常州教授艺术技巧。宝应的一些票友，如佑申和郭季良，与他结拜，这两个人还经常与他切磋技艺，他们对他的教诲怀有深刻的敬意。由于受到朱氏影响，后来的宝应研究京剧的人数颇多。

值得注意的是，朱耐根夫人魏雅兰也是一个熟练的票友。她们一起合作演出了许多戏曲作品，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》以及《探母回令》（与陈小田合作）。这些唱片是由高亭和百代两家公司灌制出来的，它们不仅展示了谭鑫培没有灌录过的声音，还成为了研究谭派声腔艺术宝贵资料（现在这几张唱片已经存放在上海图书馆）。