在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，那里的皮黄艺术深深吸引了他，他甚至得到了谭鑫培的真传。后来，他以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行义务性的演出，与另一位票友王君直并称，人们将他们誉为“南朱北王”。著名的京剧学者陈小田在他的《京剧音韵概论》一书中提到过谭派中的许多名人，朱耐根就是其中之一。

苏少卿在其撰写的文章《剧评》中，对朱耐根的声音技巧赞不绝口：“如浮云遮月”，“媲美小余，其传音区区苍劲，更是炉火纯青。”随着年龄的增长，朱耐根作为票友，在上海定居，他被当地的人尊称为“耐二爷”，并且被视为票界的一位宗师。他精通谭派唱腔，并曾经在扬州和常州教授这门艺术。与他有结拜关系的宝应票友，如佑申和郭季良，还经常与他切磋技艺，并从中学到了很多。在那时期，因为受到朱耐根影响，有更多的人开始研究京剧。

值得一提的是，朱耐根夫人魏雅兰也是一个票友。她与丈夫一起合作演出了多部戏曲作品，其中包括《法场换子》、《梅龙镇》（这是她和丈夫共同演出的）以及《探母回令》（与陈小田合作）。这些唱片因为没有谭鑫培灌制，所以成为了研究谭派声腔艺术宝贵资料（现存上海图书馆）。