在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿在《剧评》中赞扬了朱耐根的声音和唱腔，说它们“如浮云遮月”，媲美小余，还特别指出他的声音区别于其他人，更是炉火纯青。在他中年之后，朱耐根作为一名资深票友生活在上海，他被称为“耐二爷”，并且尊敬地被看作是票界中的宗师。朱氏精通谭派的唱腔，并曾经在扬州和常州传授自己的技艺。宝应的一些票友，如佑申和郭季良，与他结拜，并与之切磋技艺，从而获得了他的教益。后来，有很多宝应的人研究京剧，这也得益于朱耐根对京剧艺术的影响。而且，朱耐根夫人魏雅兰也是一个票友。

三张由高亭公司灌制的唱片收录了朱耐根独自演唱的《法场换子》，以及与夫人合作演绎的《梅龙镇》，还有与陈小田合作的一首《探母回令》。由于这三张唱片是在谭鑫培没有录制之前制作出来，所以它们成为了研究谭派声腔艺术不可多得的情报资料（现存有上海图书馆）。