在少年时期，朱耐根跟随祖父居住在北京，那里他深深爱上了皮黄戏。后来，他以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，有“南朱北王”的美称。在谭鑫培传人的京剧界中，朱耐根被视为一位杰出的艺术家。陈小田在他的著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的这些大师级人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿曾经赞扬过朱耐根的声音说：“如浮云遮月”，并且将其与小余相比，说他的声音更加苍劲，更是炉火纯青。此后，朱耐根以票友的身份生活在上海，他被尊为票界的宗师。在那里，他以精湛的谭派唱腔而闻名，并且曾经去扬州和常州传授自己的技艺。宝应的一些票友，如居佑申和郭季良，与他结拜，并从他那里学习到了许多技巧，他们都非常感激他的教导。而现在，在宝应地区学习京剧的人们很多，这也正是因为他们受到了朱氏影响。

值得一提的是，朱耐根的夫人魏雅兰也是一个票友。她和丈夫一起合作演出了《梅龙镇》，这是一场令人难忘的表演。而三张由高亭和百代两公司灌制的唱片，《法场换子》、《梅龙镇》以及《探母回令》（与陈小田合作），至今仍然作为研究谭派声腔艺术不可多得的珍贵资料保存着。这三张唱片是当时没有谭鑫培灌制过的声音资料，因此对于研究者来说具有极高价值。