在少年时光中，朱耐根跟随祖父居住于北京，他对皮黄腔的热爱深远，并得到了谭鑫培的真传。随后，朱耐根以票友的身份，在上海、杭州、汉口和常州等地进行了义务性的演出。他与另一位票友王君直齐名，被誉为“南朱北王”。著名票友陈小田在其著作《京剧音韵概论》中提到过谭派中的杰出人物，其中就包括了朱耐根。

苏少卿在《剧评》中赞扬了朱氏的声音：“如浮云遮月”，并称其唱腔媲美小余，更是技艺炉火纯青。在中年之后，朱耐根作为票友生活在上海，那里的票界尊他为“耐二爷”，将他视为一代宗师。他的声腔专长于谭派唱腔，并曾在扬州和常州传授自己的技艺。宝应的票友们，如居佑申和郭季良，与朱氏结拜，对他的艺术有着切磋之情，并深受其教诲影响。此后，宝应地区学习京剧的人数增加，这无疑是受到朱耐根影响的一部分。而且，夫人魏雅兰也是一个票友。

三张由高亭和百代公司录制的声音资料，因为没有谭鑫培参与录制，所以成为了研究谭派声乐艺术难得的资源。这三张唱片包含了《法场换子》、《梅龙镇》（与夫人合作）以及《探母回令》（与陈小田合作），这些都是研究这门艺术不可多得的珍贵资料（现在存放在上海图书馆）。